日本遊學1949年政權轉換之際，李先聞選擇了離開。“離境時，向同事們告別，差不多每位同事都異口同聲地勸我不要走，說這不過是‘換朝代’而已。我回答他們是，各人有各人的想法。遺傳學是李森科那一套，哪能不走。”（第202頁）雖然他這段回憶可能有些“倒推歷史”的嫌疑，但對他來說當然已視為事實。李先聞在臺灣從事甘蔗育種改良工作十四年，被農民譽為“半仙”和“甘蔗之神”。晚年研究水稻誘變育種，獲選優異的水稻矮稈品系，享譽國際。李先聞曾多次參加太平洋科學會議、國際植物學會、世界遺傳學大會等，為臺灣學術的復興與國際化貢獻良多。1976年7月4日，這個農家子弟的心臟停止了跳動，享年七十四歲。

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